主题:高精度蛋白质残基接触图预测(Accurate Protein Residue-Residue Contact Map Prediction)
报告人:於东军
地点:理工北楼515室
时间:11月4日下午2:00-4:00
个人简介:
於东军,南京理工大学计算机科学与工程学院智能科学与技术系教授, 博士生导师。主要研究方向为生物信息计算、机器学习、模式识别与智能系统。主持国家自然科学基金3项,主持江苏省自然科学基金及其他省部级项目12项,累计发表学术论文100篇。近年来主要从事生物信息及模式识别领域相关的课题研究,相关成果已发表在Briefings in Bioinformatics、Bioinformatics、Pattern Recognition、Machine Learning、IEEE TKDE、IEEE TNNLS等国内外刊物上。曾获江苏省科技进步三等奖1项、金沙线上娱乐场部科技进步二等奖2项。入选江苏省博士集聚计划、江苏省“333高层次人才培养工程”中青年科学技术带头人。英国The University of York计算机系及美国The University of Michigan (Ann Arbor)计算医学与生物信息学系访问学者。中国计算机学会(CCF)生物信息学专业委员会委员,中国人工智能学会(CAAI)生物信息学与人工生命专业委员会委员。http://csbio.njust.edu.cn
报告内容简介:
蛋白质是由多个氨基酸组成的长链,是生物体的必要组成成分,参与了生命活动的每一个进程。蛋白质结构决定了许多蛋白质的功能,准确预测蛋白质中氨基酸残基接触对于蛋白质结构预测具有重要意义,蛋白质残基接触问题已经成为当前生物信息领域的热点问题。本报告首先给出了蛋白质残基接触图预测的相关背景知识及其重要意义;其次,介绍了课题组应用机器学习技术在接触图预测中取得的一点进展;结合国际蛋白质结构预测比赛(Critical Assessment of protein Structure Prediction, CASP)的结果对现有模型的性能做了对比和分析;最后,针对蛋白质接触图预测中存在的若干难点问题,给出了有望取得突破的若干研究方向。